Hola, espero me de a entender, utilizo este comando para convertir videos con vlc desde un .bat en windows:
@ECHO OFF for %%a in (*.mkv) do "D:\Program Files\VideoLAN\VLC\vlc" -I dummy "%%a" --sout=#:file{dst="%%~na".mp4} vlc://quit
ahora el problema vienes cuando convierto un video con dos audios (ingles y español), aunque el audio primario sea el español al convertirlo queda el audio en ingles como primario, y al importarlo a premiere, solo me reconoce un canal de audio el ingles, pero al reproducirlo en vlc si puedo elegir el audio que quiera, entonces no se si se pueda agregar alguna linea o código mas para indicar que quiero el audio en español como primario o solo el audio en español, ya un extra si se puede hacer lo mismo con los subtítulos