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La mayoría de los comandos de larga duración se matan instantáneamente en Amazon EC2 (Ubuntu 10.04)

Cuando se ejecuta cualquier tipo de comando de larga duración en el terminal, el programa muere instantáneamente y el terminal muestra el texto Killed .

¿Algún consejo? ¿Tal vez haya un archivo de registro con datos que expliquen por qué se matan los comandos?

Actualización

Este es un fragmento de dmesg que, con suerte, debería iluminar lo que está causando el problema. Otra nota que puede ser útil es que esta es una instancia de Amazon EC2.

May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184209] Call Trace:
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184218]  [<c01e49ea>] dump_header+0x7a/0xb0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184221]  [<c01e4a7c>] oom_kill_process+0x5c/0x160
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184224]  [<c01e4fe9>] ? select_bad_process+0xa9/0xe0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184227]  [<c01e5071>] __out_of_memory+0x51/0xb0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184229]  [<c01e5128>] out_of_memory+0x58/0xd0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184232]  [<c01e7f16>] __alloc_pages_slowpath+0x416/0x4b0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184235]  [<c01e811f>] __alloc_pages_nodemask+0x16f/0x1c0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184238]  [<c01ea2ca>] __do_page_cache_readahead+0xea/0x210
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184241]  [<c01ea416>] ra_submit+0x26/0x30
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184244]  [<c01e3aef>] filemap_fault+0x3cf/0x400
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184247]  [<c02329ad>] ? core_sys_select+0x19d/0x240
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184252]  [<c01fb65c>] __do_fault+0x4c/0x5e0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184254]  [<c01e4161>] ? generic_file_aio_write+0xa1/0xc0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184257]  [<c01fd60b>] handle_mm_fault+0x19b/0x510
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184262]  [<c05f80d6>] do_page_fault+0x146/0x440
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184265]  [<c0232c62>] ? sys_select+0x42/0xc0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184268]  [<c05f7f90>] ? do_page_fault+0x0/0x440
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184270]  [<c05f53c7>] error_code+0x73/0x78
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.184274]  [<c05f007b>] ? setup_local_APIC+0xce/0x33e
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272161]  [<c05f0000>] ? setup_local_APIC+0x53/0x33e
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272163] Mem-Info:
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272164] DMA per-cpu:
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272166] CPU    0: hi:    0, btch:   1 usd:   0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272168] Normal per-cpu:
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272169] CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:  50
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272171] HighMem per-cpu:
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272172] CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:  30
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272176] active_anon:204223 inactive_anon:204177 isolated_anon:0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272177]  active_file:47 inactive_file:141 isolated_file:0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272178]  unevictable:0 dirty:0 writeback:0 unstable:0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272179]  free:10375 slab_reclaimable:1650 slab_unreclaimable:1856
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272180]  mapped:2127 shmem:3918 pagetables:1812 bounce:0May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272186] DMA free:6744kB min:72kB low:88kB high:108kB active_anon:300kB inactive_anon:308kB active_file:0kB inactive_file:0kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:15812kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:4kB shmem:0kB slab_reclaimable:8kB slab_unreclaimable:0kB kernel_stack:0kB pagetables:0kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? yes
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272190] lowmem_reserve[]: 0 702 1670 1670May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272197] Normal free:34256kB min:3352kB low:4188kB high:5028kB active_anon:317736kB inactive_anon:317308kB active_file:144kB inactive_file:16kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:719320kB mlocked:0kB dirty:4kB writeback:0kB mapped:32kB shmem:0kB slab_reclaimable:6592kB slab_unreclaimable:7424kB kernel_stack:2592kB pagetables:7248kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:571 all_unreclaimable? yes
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272201] lowmem_reserve[]: 0 0 7747 7747May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272207] HighMem free:500kB min:512kB low:1668kB high:2824kB active_anon:498856kB inactive_anon:499092kB active_file:44kB inactive_file:548kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:991620kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:8472kB shmem:15672kB slab_reclaimable:0kB slab_unreclaimable:0kB kernel_stack:0kB pagetables:0kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:430 all_unreclaimable? yes
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272211] lowmem_reserve[]: 0 0 0 0May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272215] DMA: 10*4kB 22*8kB 38*16kB 33*32kB 16*64kB 10*128kB 4*256kB 1*512kB 1*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 6744kBMay 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272223] Normal: 476*4kB 1396*8kB 676*16kB 206*32kB 23*64kB 2*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 1*2048kB 0*4096kB = 34256kBMay 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272231] HighMem: 1*4kB 2*8kB 28*16kB 1*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 500kB
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272238] 4108 total pagecache pages
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272240] 0 pages in swap cache
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272242] Swap cache stats: add 0, delete 0, find 0/0
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272243] Free swap  = 0kB
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.272244] Total swap = 0kB
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.276842] 435199 pages RAM
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.276845] 249858 pages HighMem
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.276846] 8771 pages reserved
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.276847] 23955 pages shared
May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: [11144050.276849] 405696 pages non-shared

38voto

Heath Puntos 1042

Debería ser capaz de averiguar qué mató a su proceso mirando la salida del dmesg o en los archivos de registro /var/log/kern.log , /var/log/messages o /var/log/syslog .

Hay una serie de cosas que pueden hacer que un proceso sea eliminado sumariamente:

  • Si excede el límite duro para varios tipos de uso de memoria o cpu que puedes examinar usando ulimit -H -a
  • Si el sistema tiene poca memoria virtual, los procesos pueden ser eliminados por el kernel oom-killer para liberar memoria (En tu caso, probablemente no sea esto)
  • Si el sistema tiene SELinux, y/o PaX/grsecurity instalado, un proceso podría ser matado si intenta hacer algo que no está permitido por la política de seguridad, o si intenta ejecutar código auto-modificado.

Los registros o el dmesg deberían indicarle por qué el proceso fue eliminado.

11voto

rthomson Puntos 839

Los registros que has publicado como en la actualización indican que tu sistema se está quedando sin memoria y el Asesino OOM se invoca para matar procesos con el fin de mantener la memoria libre cuando "todo lo demás falla". El algoritmo de selección para el OOM killer podría estar apuntando favorablemente a sus procesos de "larga ejecución". Vea la página enlazada para una descripción del algoritmo de selección.

La solución obvia es más memoria, pero es posible que te estés quedando sin memoria debido a una fuga de memoria en algún lugar y añadir más memoria probablemente sólo retrasaría la invocación del OOM killer si ese es el caso. Compruebe su tabla de procesos para los procesos que utilizan la mayor cantidad de memoria con su herramienta favorita (top, ps, etc.) y vaya desde allí.

4voto

yaplik Puntos 316

Como ya han explicado otros, te estás quedando sin memoria, así que out of memory killer se dispara y mata algún proceso.

Puedes arreglar esto haciendo cualquiera de las dos cosas:

a) actualice su máquina ec2 a una más potente, la "instancia pequeña" tiene 2,5 veces más memoria (1,7GB) que la "micro instancia" (0,64GB), cuesta dinero adicional

b) añadir una partición de intercambio - añadir una unidad EBS adicional, mkswap /dev/sdx , swapon /dev/sdx , cuesta el almacenamiento de EBS y las tasas de IO

c) añadir el archivo de intercambio - dd if=/dev/zero of=/swap bs=1M count=500 , mkswap /swap , swapon /swap , cuesta tasas de IO y espacio libre en EBS root

La c) debería ser suficiente, pero tenga en cuenta que la micro instancia no se supone que ejecute tareas intensivas de cpu de larga duración debido a los límites de cpu (sólo se permiten ráfagas cortas).

3voto

Delicious Puntos 21

Yo tuve el mismo problema. Mis procesos se mataban.

Descubrí que la AMI de Ubuntu que estaba usando no tenía un espacio de intercambio configurado. Cuando la memoria está llena y no hay espacio de intercambio disponible, el kernel comenzará a matar procesos de forma impredecible para protegerse. El espacio de intercambio lo evita. (Este problema es especialmente relevante para la instancia Micro debido a los pequeños 613 MB de memoria).

Para comprobar si tienes un espacio de intercambio configurado escribe: swapon -s

Configurar el espacio de intercambio: http://www.linux.com/news/software/applications/8208-all-about-linux-swap-space

Otros recursos: http://wiki.sysconfig.org.uk/display/howto/Build+su+propio+núcleo+de+CentOS+5.x+AMI+para+Amazon+EC2

1voto

Anand Jeyahar Puntos 89

El registro dice que te estás quedando sin memoria swap/cache.

    May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: \[11144050.272240\] 0 pages in swap cache
    May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: \[11144050.272242\] Swap cache stats: add 0, delete 0, find 0/0
    May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: \[11144050.272243\] Free swap  = 0kB
    May 14 20:29:15 ip-10-112-33-63 kernel: \[11144050.272244\] Total swap = 0kB

¿Puede dividir el trabajo/proceso que está ejecutando en lotes? ¿Tal vez pueda intentar ejecutarlo de forma aislada después de detener los otros procesos?

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