Acabo de probar esto. Limpiando "Sistema/Archivos Temporales" con BleachBit he eliminado los siguientes archivos:
Delete 4,1kB /tmp/sni-qt_copyq_7487-uq6jv3/icons/hicolor/48x48/apps/copyq_7487_3b113d95128bb105a6dd1b89f6652e0a.png
Delete 4,1kB /tmp/sni-qt_copyq_7487-uq6jv3/icons/hicolor/16x16/apps/copyq_7487_3b113d95128bb105a6dd1b89f6652e0a.png
Delete 4,1kB /tmp/sni-qt_copyq_7487-uq6jv3/icons/hicolor/32x32/apps/copyq_7487_3b113d95128bb105a6dd1b89f6652e0a.png
Delete 4,1kB /tmp/sni-qt_copyq_7487-uq6jv3/icons/hicolor/22x22/apps/copyq_7487_3b113d95128bb105a6dd1b89f6652e0a.png
Delete 0 /tmp/unity_support_test.1
Disk space recovered: 16,4kB
Files deleted: 5
Así que parece que Biblioteca envolvente de Ubuntu para mostrar QSystemTrayIcon almacena el archivo de la imagen del icono en el directorio temporal. Curiosamente, la biblioteca utilizará un icono no válido si se elimina la imagen.
Después de reiniciar CopyQ el icono vuelve a estar en su sitio.
Eliminar los archivos temporales al azar no es una buena práctica. Sí, podría haber algunos archivos antiguos, pero también puede contener algunos datos importantes o copias de seguridad. CopyQ utiliza archivos temporales cuando se editan elementos en un editor externo.