Hay un par de aspectos en tu pregunta.

La disparidad entre lo que Discover y el terminal muestran en las actualizaciones:

Es posible que Discover te haya mostrado más actualizaciones que el terminal: mi respuesta aquí puede ser relevante. Pero no uso Discover mucho y por lo tanto la razón real para la disparidad puede ser otra.

Editar: Hoy, 20200520,

• en Kubuntu 20.04, se me ofrecen los mismos cuatro paquetes por Discover y por sudo apt full-upgrade (a través del terminal): gir1.2-secret-1 liblirc-client0 libsecret-1-0 libsecret-common.
• en KDE neon, se me ofrecen los mismos trece paquetes.

Seguiré comprobando futuras actualizaciones para ver si hay alguna divergencia.

Los paquetes relacionados con el desarrollo:

¡Nada específico de Kubuntu aquí! Por alguna razón, estos paquetes se están distribuyendo también a otras variantes de *buntu. Aquí está la salida de Lubuntu 20.04:

Los siguientes paquetes NUEVOS se instalarán:
  binutils binutils-common binutils-x86-64-linux-gnu build-essential dpkg-dev fakeroot g++ g++-9
  gcc gcc-9 libalgorithm-diff-perl libalgorithm-diff-xs-perl libalgorithm-merge-perl libasan5
  libatomic1 libbinutils libc-dev-bin libc6-dev libcc1-0 libcrypt-dev libctf-nobfd0 libctf0
  libdpkg-perl libfakeroot libfile-fcntllock-perl libgcc-9-dev libitm1 liblsan0 libquadmath0
  libstdc++-9-dev libtsan0 libubsan1 linux-headers-5.4.0-31 linux-headers-5.4.0-31-generic
  linux-image-5.4.0-31-generic linux-libc-dev linux-modules-5.4.0-31-generic
  linux-modules-extra-5.4.0-31-generic make manpages-dev

Observa el "NUEVOS" en

Los siguientes paquetes NUEVOS se instalarán:

Por lo tanto, estamos recibiendo esos paquetes no a través de actualizar paquetes existentes.

Para concluir, puedes usar cualquiera de las rutas para mantener tu sistema actualizado e instalar nuevos software pero aún prefiero, y recomiendo, el terminal.